Análise de fluxo sempre se faz pelos contratos padrão (tanto o taimes & trades, como o book de ofertas), pois os big players, movedores de tendência, operam majoritariamente nos padrões. Na maioria dos casos, quando um player grande atua nos minis é para fazer operações não direcionais (arbitragem, estratégias HFT etc). Isso vale para índice ou dólar. No meu caso, se vou negociar mini, deixo só o super dom (que é por onde executo minhas ordens) configurado no mini.
Mas vale ressaltar que a forma como cada um executa sua ordem é bastante particular. alguns usar boleta normal, outros a "boleta day trade" ou boleta scalper (no caso do profit), ou ainda "cross order" (quando você opera como se fosse cheio, mas a plataforma cruza a execução para o mini). Enfim, isso vai da preferência de cada um.