Você sempre terá que pagar taxas e emolumentos. As corretoras se sustentam com essas taxas por intermediar os negócios e os emolumentos são a remuneração da própria B3 por gerir o ambiente de negociação.
Preocupe-se em cumprir seu método e critérios à risca e em operar bem e encare taxas e emolumentos como o ingresso que você paga para assistir à um show, ou a ficha da sinuca, por exemplo.
Claro que o custo é um ponto importante, mas acredito que a estratégia já deva considerar isso. Portanto, se as suas operações geram lucro líquido (excluindo custos e imposto), então, não importa se são muitas ou poucas operações, pois na ponta final o resultado é positivo.